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GNS3は、複雑なネットワークトポロジを設計するためのグラフィカルなネットワークシミュレータです。単純なワークステーションからパワフルなCiscoルーターまでの幅広いデバイスの設定とシミュレーションを行うことができます。Dynamips、Pemu/QEMU、Dynagenをベースにしています。

Nsは、研究ネットワークをターゲットにした離散事象シミュレータです。 Nsは、TCPシミュレーション、ルーティング、有線および無線(ローカルおよび衛星)ネットワーク上でのマルチキャストプロトコルのためのサポートを提供します。

Sweet Home 3D は、インテリアデザイン用のJavaアプリケーションです。エンドユーザが作成した2Dの間取りプランに家具を配置し、3Dでプレビューできます。

SUMOは、主にドイツ航空宇宙センター（DLR）が開発している顕微鏡と継続的な道路交通シミュレーションソフトウェアです。

APBSは、広範囲な長さのスケールの分子溶質間の静電相互作用をを記述する連続体モデルのための、ポアソン・ボルツマン方程式の数値解法のソフトウェアパッケージです。http://apbs.sf.net/

オープンソースの模型ロケットのシミュレータです。

KODS is a port of KDP-2(http://www.ecalculations.com) for Linux, MacOSX, Android. It has gfortran based CUI program and Qt based GUI

CEDAR LSは、論理設計の教育や簡単なデジタルデザインをテストに使用できるインタラクティブなデジタル論理シミュレータです。高レベルのコンポーネントとして双方の低レベルの論理ゲートの機能の機能と、またレジスターとZ80マイクロプロセッサーエミュレータも含みます。

GLUIは、OpenGPLアプリケーションに対してボタン、チェックボックス、ラジオボタン、スピナーなどのコントロールを提供するGLUTベースのC++ユーザーインターフェースライブラリです。各種のウィンドウシステムからは独立して使用できます。

Webベースの共同研究ためのぷらっとホームとハイパフォーマンスコンピューティングのインターフェース、仮想研究室を実装するためのツールです。

GNU回帰、計量経済学、時系列ライブラリ

Logisimは、デジタル論理回路の設計とシミュレーションのための教育用ツールであり、インターフェース、階層回路、ワイヤバンドル、大規模なコンポーネントライブラリを簡単に学ぶことができます。Javaアプリケーションとして、多くのプラットフォーム上で実行することができます。