OSDN -- Desenvolver e Download de Software Open Source
Estado tradução de Português translation status for pt

RSS
Download List

Projeto Descrição

BioJava aims to provide a comprehensive set of Java components for the rapid development of applications in Bioinformatics. It contains interfaces for representing Sequences, Features, and other important bioinformatics concepts. It can also read and write sequence data in a variety of common formats and communicate with Ensembl databases and with DAS and BioCorba servers.

System Requirements

System requirement is not defined
Information regarding Project Releases and Project Resources. Note that the information here is a quote from Freecode.com page, and the downloads themselves may not be hosted on OSDN.

2002-03-15 16:35
1.21

Esta versão inclui o propósito geral seqüência de armazenamento de dados em bancos de dados de seqüência BioSQL (ler e escrever), acrescenta o demo Blast2Html faltando, e inclui diversas correções de documentação.
Tags: Minor feature enhancements
This release includes general-purpose sequence data storage in BioSQL sequence databases (read and write), adds the missing Blast2Html demo, and includes various documentation fixes.

2002-02-13 17:41
1.20

BioJava 1,2 inclui melhorias consideráveis para os analisadores para a saída de fornos e formatos de arquivo de seqüência. Há também um pacote de programação melhorado dinâmico, que pode compilar Hidden Markov Models para bytecode Java, e apoio para a Distributed Annotation System 1,00.
Tags: Major feature enhancements
BioJava 1.2 includes considerable enhancements to the parsers for
Blast output and sequence file formats. There's also an improved
dynamic programming package, which can compile Hidden Markov Models to
Java bytecode, and support for the Distributed Annotation System 1.00.

2001-02-16 21:48
1.10

Pluggable I / O quadro para os dados de seqüência, analisadores para fornos e saída FASTA, suporte para a montagem de seqüências biológicas, e um modelo de evento generalizada de notificação de alteração e de veto.
Tags: Major feature enhancements
Pluggable I/O framework for sequence data, parsers for Blast and FASTA output, support for assembly of biological sequences, and a pervasive event model for change notification and veto.

2001-01-30 15:12
1.01

Alguns bugs foram corrigidos com a compilação com 1,3 javac e JBuilder. Suporte para linhas mais longas descrição em arquivos FASTA foi adicionado. SimpleDistributions pode agora ser treinados adequadamente.
Some bugs were fixed with compiling with javac 1.3 and JBuilder. Support for longer description lines in FASTA files was added. SimpleDistributions can now be trained properly.

2001-01-30 15:12
1.0

Initial release.
Initial release.

Project Resources

Project Page Download: Log de Alterações Download: CVS Home Page Download: List Download: TGZ