Biomolecule Toolkit

Esta é uma versão de manutenção da biblioteca Core BTK, contendo documentação de atualizações, correções e adições de recursos menor. Interfaces destinam-se a ser compatível com a versão 0.8, embora em alguns casos, re-compilação será necessária.

Este lançamento representa uma reescrita completa e reorganização das classes núcleo estável do Toolkit Biomolecule. Incluem-se as classes para representar os átomos, moléculas, polímeros e sistemas multi-molécula, junto com o PDB-formatado E / S, rotinas matemáticas e algoritmos que são úteis para a modelagem molecular.

Esta é a liberação de um desenvolvedor de actualização do Toolkit Biomolecule (BTK). Mudanças significativas incluem além de superposição ótimo e rápido RMSD funções, além da proteína N-terminal e C-terminal de grupos, a conversão do átomo de uso geral baseada em algoritmos para código de modelo para uso com diferentes tipos de iterator, fixou para a construção de amida espinha dorsal da proteína prótons e proteína backbone átomos de oxigênio da carbonila, alterações significativas ao armazenamento / atom sistema de pesquisa para a generalidade aumentou, ea migração do código de álgebra linear subjacente à Boost:: Biblioteca uBLAS.

Esta é a liberação de um desenvolvedor do BTK. Mudanças significativas incluem a adição de tradução corpo estático, rotação, de centro-de-massa e cálculos do eixo principal, a criação de um corpo estático de classe construível Molecule extensa e limpeza do edifício molécula / código de dobradura. Além disso, a classe PredicateIterator foi introduzido para uso na iteração molécula seletivo. Por último, tem havido numerosas limpeza de código e correções.

Esta é a liberação de um desenvolvedor de actualização do Toolkit Biomolecule. Alterações nesta versão inclui uma reescrita da interface do leitor de pdb, renomeando extensa de classes e métodos, o movimento de armas atómicas coordenar a representação para a classe base molécula, e uma série de correções de bugs e limpeza de código geral.