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Projeto Descrição

Py_ContigViewer is a contig viewer, a stand alone
cross-platform desktop application that uses CAP3
alignments to graphically display and validate
candidate SNPs and InDels. It also simplifies PCR
oligo design in an interactive mode. The extended
mode provides the display of BLAST hits of
annotated sequences with intron positions for the
selected contig. Py_ContigViewer works in
conjunction with DIS (Deletion, Insertion,
Substitution) SNP discovery pipeline at
http://www.atgc.org/SNP_Discovery/.

System Requirements

System requirement is not defined
Information regarding Project Releases and Project Resources. Note that the information here is a quote from Freecode.com page, and the downloads themselves may not be hosted on OSDN.

2004-04-20 05:23
Apr_19_2004

Esta versão oferece transferência de dados transparente para o programa perlprimer através de um soquete de rede. Ele simplifica o projeto oligo porque não há mais a necessidade de executar "salvar como" / "abrir como" diálogos. Ele também permite a configuração dos parâmetros de exibição usando um arquivo de configuração.
Tags: Minor feature enhancements
This release provides transparent data transfer to the PerlPrimer program via a network socket. It simplifies oligo design because there is no longer a need to run "save as" / "open as" dialogs. It also allows configuration of display parameters using a config file.

2004-03-26 05:50
Mar_25_2004

Esta versão gera arquivos de saída em formato FASTA com informações sobre regiões selecionadas para o projeto oligo que podem ser usados diretamente pelo programa perlprimer. A função de busca de textos foi melhorada, e exibição de conteúdo GC% para seqüências consenso foi implementado.
Tags: Minor feature enhancements
This version generates output files in FASTA format with
information about selected regions for oligo design that
can be used directly by the PerlPrimer program. The
search function for substrings was improved, and
displaying of GC% content for consensus sequences was
implemented.

2004-03-16 20:25
Mar_12_2004

Tags: Initial freshmeat announcement

Project Resources