1.8.6 released (Glang-users) - G-language

g.

1.8.6リリースしました。

主要な変更は
1. GCSIがウインドウサイズに依存しない新バージョンになりました。
　現在関連論文投稿準備中です。
2. G-language Shellで、UNIXパイプが使えるようになりました。
　例えば
　$gb->find() | grep "replication" | head -n 5 > out.txt
　のようなことが可能です。パイプした先は完全にUNIXシェルに
　なっていますので、通常のシェルでできることはなんでもできます。

changelogは以下の通り。

===== v.1.8.6    2009.03.11  =====
   *fixed a bug in $gb->before_startcodon, after_startcodon,  
before_stopcodon, after_stopcodon, where the functions returned wrong  
sequence when the requested length was not available at sequence ends.
   *fixed a bug for	handling -type option in G::Seq::PatSearch and  
find_dif()
   *added G::Tools::Statistics::cumulative()
   *fixed a bug in $gb->stopcodon() which was not working properly,  
probably since 1.8.4
   *modified $gb->pos2gene() and $gb->pos2feature() to accept two  
positions to obtain features existing within these positions.
   *updated gcsi() to version 2.
   *added UNIX piping for G-language Shell. For example, now you can  
do the following:

   $gb->find() |grep replication |head -n 5

Kazuharu Arakawa, Ph.D.
Institute for Advanced Biosciences, Keio University
252-8520 Japan   Tel/Fax: +81-466-47-5099

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