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50 projects in result set
Última Atualização: 2020-06-01 00:48

APBS

APBSは、広範囲な長さのスケールの分子溶質間の静電相互作用をを記述する連続体モデルのための、ポアソン・ボルツマン方程式の数値解法のソフトウェアパッケージです。http://apbs.sf.net/

Última Atualização: 2016-12-03 05:56

Avogadro

Avogadroは、計算化学、分子モデリング、バイオインフォマティクス、材料科学、およびそれらの関連分野で使用するための高度でクロスプラットフォームな分子エディタです。柔軟なレンダリングのフレームワークと強力なプラグインアーキテクチャを提供しています。

Última Atualização: 2014-08-26 05:14

picard

(ジャワ) における次世代シーケンシング形式のデータを BAM (http://samtools.sourceforge.net) を扱うためのツールのセットです。

(Machine Translation)
Última Atualização: 2006-08-19 01:11

ProbeMaker

!ProbeMaker はオリゴヌクレオチドのプローブのセットの設計のためのフレームワークです。プローブを別のシーケンスの要素の構成のさまざまな種類のデザインをことができます。プラグイン機構で新しい機能を持つフレームワークを拡張をできます。

(Machine Translation)
Desenvolvimento Estado: 5 - Production/Stable
Sistema Operacional: OS Independent
Linguagem de Programação: Java
Interface de Usuário: Java Swing, Command-line, Console/Terminal
Última Atualização: 2020-07-28 20:51

ShelXle

!ShelXle エディター SHELXL 関連付けられている .ins (入力) と .res (出力) ファイルの電子密度 (Fo) と違い密度を含む 3次元構造の可視化、インタラクティブなグラフィカル表示と (Fc シリーズプラグハウジング) マップを強調構文で組み合わせたものです。J. 応用したを参照してください。(2011 年). 44、1281–1284。詳細については。

(Machine Translation)
Última Atualização: 2019-08-17 21:06

Molby - A Molecular Modeling Software

Molby is a software for building molecular models on the graphic screen. It works on Mac OS X and Windows. It can import and export files for other computational chemistry softwares such as GAMESS and Gaussian. It can also edit molecules by script...

Desenvolvimento Estado: 5 - Production/Stable
Destinado Audiência: Science/Research
Linguagem Natural: English, Japanese
Sistema Operacional: MacOSX, Windows XP
Linguagem de Programação: C, C++, Ruby
Interface de Usuário: wxWidgets
Register Date: 2010-01-21 01:18
Última Atualização: 2018-05-04 23:51

Toxtree: Toxic Hazard Estimation

化学物質の毒性の危険性を推定する GUI アプリケーションです。最新バージョンは、次の毒性予測モジュールを含む:-Cramer のルール (経口毒性) - Verhaar を介してアクションの毒性モード スキーム - 皮膚の炎症や目の炎症の予測 - ベニーニ/ボッサ ルールベースの変異原性および発がん性の予測-開始の生分解性と永続性の予測-皮膚感反応性ドメイン - クルースは TTC デシジョン ツリー - SMARTCyp - Cytochrome P450-Mediated 薬物代謝と代謝予測-in vivo 小核試験の構造警告アッセイの齧歯動物 (ISSMIC) で-構造アラート機能グループ識別 (ISSFUNC)-結合蛋白結合に関連する構造のアラートDNA の結合。-Ames 変異原性 Toxtree を推定への異なるアプローチを組み込むプラグイン フレームワークを提供します。プラットフォームに依存しない (Java で書かれた) 化学開発キットを使って。

(Machine Translation)
Última Atualização: 2020-03-05 06:29

LAMMPS

LAMMPSは並列計算機のために設計された古典的な分子動力学シミュレータです。これは様々な力場と境界条件を使用して、原子、高分子、生物、金属、中規模システムのモデルを作ることができます。また、簡単に変更したり拡張することができます。

Última Atualização: 2009-04-14 10:21

DNAStrider

Mac osx 版、もう os9 をサポートしていない Lepard にアップグレードします。このプロジェクトはビルド DNA ストライダー飛竜のヘルプをユーザーが自分のデータを取得し、いくつかの基本的な DNA の実行を分析関数。

(Machine Translation)
Database Environment: SQLite
Desenvolvimento Estado: 3 - Alpha
Destinado Audiência: End Users/Desktop, Education, Science/Research
Linguagem Natural: English
Sistema Operacional: MacOSX, Linux, Windows XP
Linguagem de Programação: REALbasic
Interface de Usuário: Carbon (Mac OS X), KDE, Win32 (MS Windows)
Última Atualização: 2019-06-28 10:34

ERmod

ERmod (エネルギー表現モジュール) は、エネルギー表示法による溶媒和自由エネルギーを計算するためのプログラム (j. 化学物理 113、6070 (2000))。プログラムは、不均一系を含む、任意の溶剤の溶媒和自由エネルギーを計算することができる、NAMD、GROMACS やオレンジなどの最先端の分子シミュレーション ソフトウェアとの連携で実行することができます。

(Machine Translation)
Última Atualização: 2015-03-07 05:42

SketchEl

様々なケムインフォマティクスアプリケーションで使用するための化学構造のスケッチツールです。MDL MOLファイルの作成と編集に適しています。

Última Atualização: 2007-02-22 17:33

PyMOL Plugins

PyMOL Pluginsは、PyMOLの多くのプラグインを提供することを目指します。このウェブサイト上でPyMOLについてより詳細な情報を見つけることができます:http://www.pymol.org/

Última Atualização: 2010-04-27 22:26

NMRShiftDB

NMRShiftDB は、化学構造と核磁気共鳴データについては、オープン ソース、オープン アクセス、オープン提出、オープン コンテンツの web データベースです。

(Machine Translation)
Desenvolvimento Estado: 5 - Production/Stable
Linguagem Natural: English
Sistema Operacional: OS Independent
Linguagem de Programação: Java
Interface de Usuário: Web Environment
Última Atualização: 2007-06-07 03:42

NOCH

NOC はオープン ソース開発ツールキットおよび表示、タンパク質構造の可視化、解析、結晶学的マッピング、モデリング、および洗練された、Gromacs/アンバー MD 軌道の強力な分子エクスプ ローラー映画作り.

(Machine Translation)
Última Atualização: 2011-01-18 09:43

vancouvershortr

このパッケージは短い読み取り DNA シーケンシング技術で使用するためのコードが含まれているし、チップ Seq、シーケンス処理全体トランスクリプトーム散弾銃、全ゲノムの散弾銃の配列、SNP 検出、転写産物発現およびファイル変換パッケージが含まれています。

(Machine Translation)